- "Jesu, in te confido!" - Jezu, ufam Tobie! - to biskupie zawołanie było dewizą jego życia i pasterskiej posługi. Dziś, w Jubileuszowym Roku Miłosierdzia, stało się wymownym zawołaniem ogłaszającym wypełnienie dzieła, jakie powierzył mu Pan już w akcie chrztu – napisał w specjalnym telegramie papież Franciszek, który został odczytany na początku mszy żałobnej.
Nabożeństwo żałobne zostało odprawione na placu przed Katedrą Wawelską. Mszy przewodniczył kard. Stanisław Dziwisz, który wygłosił też specjalną homilię. Po nabożeństwie trumna z ciałem kard. Macharskiego została wniesiona do katedry, gdzie po krótkiej modlitwie przed konfesją św. Stanisława, spoczęła w krypcie biskupów krakowskich. Tu pochowany został m.in. kard. Adam Stefan Sapieha, wielki poprzednik kard. Franciszka Macharskiego.
Kard. Macharski zmarł we wtorek, 2 sierpnia 2016 r. Miał 89 lat.