Przekształcenia w żaden sposób nie zakłóciły funkcjonowania szpitala. Nie ma żadnych utrudnień dla pacjentów. Wszyscy dotychczasowi pracownicy szpitala im. Rydygiera pracują nadal na swoich stanowiskach. Nowy zakład przejął także dotychczasowy kontrakt szpitala im. Rydygiera podpisany z Narodowym Funduszem Zdrowia.
Nowy podmiot rozpoczyna działalność bez zadłużenia, które ciążyło na Wojewódzkim Szpitalu Specjalistycznym im. L. Rydygiera. Po zakończeniu czynności likwidacyjnych – czyli po 31 stycznia 2011 r. – Województwo Małopolskie przejmie zobowiązania i należności zlikwidowanej placówki, a następnie będzie mogło wystąpić o przyznanie dotacji w wysokości równej przejętym zobowiązaniom publicznoprawnym i zobowiązaniom wynikającym z kredytu zaciągniętego na podstawie ustawy o pomocy publicznej i restrukturyzacji, co zostało przewidziane w tzw. rządowym planie B. Łączna kwota dotacji może wynieść nawet 28 mln zł.
Przekształcenia stanowią konsekwencję podjętej przez Sejmik 30 listopada 2009 r. decyzji o uczestnictwie Województwa Małopolskiego w programie wieloletnim pod nazwą „Wsparcie jednostek samorządu terytorialnego w działaniach stabilizujących system ochrony zdrowia” (czyli w tzw. rządowym planie B) i przyjęcia programu reorganizacji w systemie ochrony zdrowia na obszarze województwa.
25 stycznia 2010 r. Sejmik podjął uchwałę w sprawie powołania jednoosobowej spółki Województwa Małopolskiego pod firmą „Szpital Specjalistyczny im. Ludwika Rydygiera w Krakowie” sp. z o.o. z siedzibą w Krakowie, ze 100% udziałem Województwa Małopolskiego. 18 lutego 2010 r. Zarząd Województwa Małopolskiego zadecydował o objęciu udziałów w nowej spółce Szpital Specjalistyczny im. Ludwika Rydygiera w zamian za wkład pieniężny (500 tys. zł). Po zakończeniu procesu likwidacji Województwo Małopolskie wniesie do spółki cały majątek zlikwidowanego Szpitala tym samym podnosząc wartość kapitału zakładowego Spółki do wysokości ponad 300 mln zł.
22 lutego 2010 r. Sejmik przyjął uchwałę w sprawie likwidacji Samodzielnego Publicznego Zakładu Opieki Zdrowotnej Wojewódzkiego Szpitala Specjalistycznego im. Ludwika Rydygiera w Krakowie i przejęciu zadań likwidowanego zakładu przez Niepubliczny Zakład Opieki Zdrowotnej utworzony przez spółkę Województwa Małopolskiego „Szpital Specjalistyczny im. Ludwika Rydygiera w Krakowie”.
Zgodnie z zapisami tej uchwały, po zawarciu umów cesji 30 czerwca 2010 r. spełnione zostały wszystkie wymogi związane z przejęciem realizacji świadczeń Wojewódzkiego Szpitala Specjalistycznego im. Ludwika Rydygiera w Krakowie przez Szpital Specjalistyczny im. Ludwika Rydygiera w Krakowie sp. z o.o. Od 1 lipca 2010 r. nowy podmiot rozpoczął udzielanie świadczeń medycznych w tym samym zakresie, w jakim działał dotychczas Wojewódzki Szpital Specjalistyczny im. Ludwika Rydygiera w Krakowie.
Starania o objęcie szpitala im. Rydygiera tzw. planem B prowadzone były przez Województwo Małopolskie w ciągu ostatniego półrocza. Podjęto działania związane z nieodpłatnym udostępnieniem mienia spółce, a także zapewnieniem środków finansowych niezbędnych na zabezpieczenie pierwszych miesięcy działalności poprzez udzielenie spółce kredytu w wysokości 21,65 mln zł.
Od momentu rozpoczęcia likwidacji, tj. od 1 kwietnia 2010 r. Urząd Marszałkowski Województwa Małopolskiego pozostawał w stałym kontakcie zarówno z likwidatorem Samodzielnego Publicznego Zakładu Opieki Zdrowotnej Wojewódzkiego Szpitala Specjalistycznego im. Ludwika Rydygiera jak i z prezesem nowopowołanej spółki. Kwestia przekształceń szpitala była także przedmiotem konsultacji prowadzonych ze służbami Wojewody Małopolskiego jak również Małopolskiego Oddziału Wojewódzkiego Narodowego Funduszu Zdrowia.
