W 2009 r. Fundacja realizowała trzy programy stypendialne, udzielając wsparcia 252 osobom na łączną kwotę 886 000 zł. Pierwszym z nich był Program Stypendialny SAPERE AUSO 2009/2010, który zakładał przyznanie stypendiów za szczególne osiągnięcia naukowe dla studentów, za szczególne osiągnięcia artystyczne dla uczniów gimnazjów, szkół ponadgimnazjalnych i dla studentów oraz za szczególne osiągnięcia sportowe dla uczniów gimnazjów, szkół ponadgimnazjalnych i dla studentów. Ponadto po raz pierwszy uruchomiono stypendia dla uczniów i studentów niepełnosprawnych. W jego wyniku przyznano 239 stypendiów o łącznej wysokości 858 500 zł. Finansowanie Programu bazowało na dotacji Województwa Małopolskiego.
Program Stypendialny SAPERE AUSO w zakresie łącznej wartości przyznanych stypendiów przewyższył każdą z sum przeznaczonych na wsparcie stypendialne w trzech poprzednich latach. W porównaniu z rokiem ubiegłym, stypendystów Programu było o 68 osób więcej.
Drugi program - Młode Talenty Małopolski - zakładał przyznanie małopolskim uczniom dofinansowania do udziału w międzynarodowych wydarzeniach edukacyjnych takich jak olimpiady, turnieje, konkursy. Z programu skorzystało 8 uczniów na łączną sumę 8 000 zł. Dotacja Województwa Małopolskiego do Programu wynosiła 20 000 zł.
Trzecim programem był uruchomiony przy współpracy z Małopolską Agencją Rozwoju Regionalnego S.A. – Program Stypendialny Rozwoju Regionalnego. Jego założeniem jest udzielanie stypendiów dla studentów posiadających wysoką średnią ocen i przygotowujących prace magisterskie z zakresu przedsiębiorczości, innowacji i rozwoju regionalnego. W roku akademickim 2009/2010 przyznano 3 roczne stypendia na łączną sumę 13 500 zł. Program będzie kontynuowany w kolejnym roku akademickim.
Ponadto Fundacja wypłaciła dwie Nagrody Sapere Auso. Pierwszą z nich - w kwowie 1 000 zł - otrzymała Klaudia Kulawik, uczennica Szkoły Podstawowej z Chechła w gminie Klucze, posiadająca szczególne osiągnięcia artystyczne w dziedzinie śpiewu. Drugą z Nagród - na kwotę 5 000 zł - otrzymał Radosław Zawrotniak, krakowski olimpijczyk, student AWF, szermierz.
Podczas obrad omówiono także inne obszary statutowej działalności Fundacji. W dniach 23-24 maja 2009 r. Fundacja zorganizowała pierwsze w historii Dni Sapere Auso. Ponadto, Fundacja uruchomiła swój profil na portalu www.nasza-klasa.pl. Obecnie jest tam zarejestrowanych 80 osób, głównie z ostatnich dwóch edycji Programu Stypendialnego Sapere Auso.