Modernizacje w obrębie SOR-u rozpoczęto już w latach 2008-2009, kiedy to z budżetu województwa małopolskiego została przyznana dotacja w wysokości 2,3 mln zł na sfinansowanie robót zewnętrznych, ciepłej sieni, windy dla niepełnosprawnych, wejścia głównego oraz opracowanie dokumentacji medycznej.
Projekt zakładał realizację 3 głównych zadań: przebudowę budynku, budowie lądowiska dla helikopterów oraz zakup aparatury i wyposażenia. W otwartym dziś budynku uległ zmianie układ funkcjonalny całego SOR-u, gdzie do tej pory brakowało oddzielenia obszaru konsultacyjnego od obszaru nagłych interwencji. Wcześniejszy układ powodował zamieszanie i sprawiał, że czas oczekiwania na pomoc wydłużał się.
Również dotychczas istniejąca płyta dla helikopterów wymagała modernizacji i wcześniej uległa rozbiórce. Teren o powierzchni 225 m. kw. został ogrodzony, oświetlony i wyposażony w system monitorowania. Całodobowe lądowisko może przyjmować śmigłowce z chorymi niezależnie od warunków atmosferycznych.
Całkowity koszt modernizacji to ponad 15,5 mln zł, z czego prawie 12 mln zł stanowi dofinansowanie z Unii Europejskiej.
