Był nauczycielem w Zespole Szkół w Piotrkowicach Małych i w Zespole Szkół w Proszowicach. Był radnym Rady Miejskiej w Proszowicach, radnym Powiatowej Izby Rolniczej, działaczem Polskiego Stronnictwa Ludowego, druhem Ochotniczej Straży Pożarnej w Opatkowicach, blisko związany z parafią Proszowice.
Jan Makowski był burmistrzem Gminy i Miasta Proszowice trzech kadencji w latach 2002-2014. Wybrany został w wyborach bezpośrednich jesienią 2002 roku. Zakończył pracę w urzędzie 7 grudnia 2014 roku.
Społeczność samorządowa Małopolski straciła działacza oddanego sprawom społecznym. Jego praca będzie służyła kolejnym pokoleniom. Rodzinie i bliskim śp. Jana składam wyrazy współczucia
- mówi marszałek Witold Kozłowski.
Wieczne odpoczywanie racz mu dać, Panie.